Это можно сделать с помощью простого скрипта.
import bpy
# iterate through the shape keys of the active object
for shapeKey in bpy.context.object.data.shape_keys.key_blocks:
# toggle (if true set it to false and vice versa)
shapeKey.mute = not shapeKey.mute
Скопируйте данный код в текстовый редактор Blender (Text Editor). Каждый раз при запуске скрипта, все Shape Keys будут переключать свою видимость.
Для большего удобства можно также воспользоваться аддоном.